Le Comité national de l'eau (CNE) a pour mission de donner son avis sur :

• les circonscriptions géographiques des bassins et groupements de bassins, ainsi que sur tout problème commun à deux ou plusieurs bassins ou groupements de bassin
• les projets d'aménagement et de répartition des eaux ayant un caractère national, ainsi que sur les grands aménagements régionaux ainsi que les projets de décret concernant la protection des peuplements piscicoles et conchylicoles
• le prix de l'eau facturé aux usagers et la qualité des services publics de distribution d'eau et d'assainissement, sur proposition d'un comité consultatif constitué en son sein.

En outre, le CNE est consulté sur les grandes orientations de la politique de l'eau, sur l'élaboration de la législation ou de la réglementation en matière d'eau, et sur les projets de schémas directeurs d'aménagement et de gestion des eaux (SDAGE) et de programmes de mesures. Il peut également produire des avis sur tout sujet d'importance ayant trait à l'eau. Le CNE ne possède pas de pouvoir de décision, mais ses avis sont motivés et influencent la définition de la politique de l'eau dans le pays

Le Comité national de l'eau (CNE) est composé de 166 membres titulaires, répartis en différents collèges, à savoir :

• État et établissements publics
• Usagers
• Collectivités territoriales
• Présidents de comités de bassin et de comités de l'eau et de la biodiversité
• Présidents de commissions locales de l'eau
• Personnalités qualifiées

Les membres du CNE sont nommés pour une durée de six ans, et lorsqu'un membre est remplacé en cours de mandat, son successeur est nommé pour la durée restante du mandat