Un comité de bassin est composé de trois principaux collèges de membres, représentant une diversité d'acteurs impliqués dans la gestion de l'eau au sein d'un bassin hydrographique :

1. Les représentants des collectivités territoriales et de leurs groupements : Ce collège représente 40% des membres du comité de bassin. Il inclut des représentants des conseils généraux et régionaux, ainsi que des communes ou de leurs groupements compétents dans le domaine de l'eau

2. Les représentants des usagers de l'eau et des milieux aquatiques, des organisations socioprofessionnelles, des associations agréées de protection de l'environnement et de défense des consommateurs, des instances représentatives de la pêche et de personnes qualifiées : Ce collège constitue également 40% des membres du comité. Il rassemble une large gamme d'usagers et d'acteurs impliqués dans la gestion et la protection de l'eau et des milieux aquatiques

3. Les représentants de l'État ou de ses établissements publics concernés : Ce dernier collège représente 20% des membres du comité de bassin, incluant des représentants de l'État et de ses établissements publics ayant un lien avec la gestion de l'eau

Le président du comité de bassin est élu par les représentants des deux premiers collèges (collectivités territoriales et usagers). La composition du comité de bassin est arrêtée par le préfet coordonnateur de bassin, à l'exception de la Corse où des règles particulières s'appliquent

• Il définit les orientations de l'action de l'agence de l'eau et participe à l'élaboration de ses décisions financières
• Il est consulté sur l'opportunité des actions significatives d'intérêt commun au bassin envisagées et, plus généralement, sur toutes les questions relatives à la gestion de l'eau et des milieux aquatiques. Il donne son avis sur divers programmes et projets, y compris le programme de mesures, le programme de surveillance de l'état des eaux, les projets de classements des cours d'eau, et les objectifs environnementaux des milieux marins
• Il adopte l'état des lieux et le schéma directeur d'aménagement et de gestion des eaux (SDAGE), et élabore le registre des zones protégées. Il est également impliqué dans l'approbation de la politique foncière de sauvegarde des zones humides menée par l'agence de l'eau
• Le comité peut être consulté par le ministre chargé de l’environnement, le président du Conseil d’administration de l’agence de l’eau, et le préfet coordonnateur de bassin sur toutes questions de sa compétence. Il joue un rôle dans la mise en œuvre de la directive inondation et peut donner son avis sur le périmètre et le délai dans lequel doivent être élaborés ou révisés les schémas d'aménagement et de gestion des eaux (SAGE)

En somme, il joue un rôle essentiel dans l'animation de la concertation entre les usagers de l'eau, les élus et l'État pour la gestion de la ressource en eau et des milieux aquatiques

Pour participer aux débats des comités de bassin, plusieurs possibilités existent. Tout d'abord, les membres du comité de bassin peuvent être consultés par le ministre chargé de l'environnement et le président du conseil régional. De plus, le comité de bassin peut, sur décision de son président, entendre toute personne extérieure dont l'audition est de nature à éclairer ses délibérations. Les personnes ainsi entendues ne participent pas au vote. En outre, les citoyens peuvent également s'impliquer en contribuant aux consultations publiques organisées dans le cadre de l'élaboration du schéma directeur d'aménagement et de gestion des eaux (SDAGE), qui fixe les orientations fondamentales de la politique de l'eau pour 15 ans