La formation des lagunes est un processus complexe qui s'est déroulé sur plusieurs millénaires.
Les lagunes méditerranéennes ont commencé à se former il y a environ 10 000 ans, à la fin de la dernière glaciation. Nous distinguons trois types principaux de lagunes selon leur origine :
- Les lagunes sédimentaires
- Les lagunes tectoniques
- Les lagunes estuariennes ou deltaïques
Le réchauffement climatique a entraîné la fonte des calottes glaciaires. Le niveau de la mer s'est progressivement élevé, se stabilisant il y a environ 6 000 ans.
Les vagues et les courants marins ont transporté des sédiments le long du rivage. Ces sédiments ont progressivement formé un cordon sableux appelé lido.
Le lido a isolé des étendues d'eau côtières, créant ainsi les lagunes.
Les rivières se jetant dans ces zones ont apporté des alluvions. Ces apports ont contribué à la formation de flèches littorales et de cordons sédimentaires.